Besonders sicherheitsbewusste Nutzer, die ihren Rechner mit anderen Benutzern teilen, können mit dem CCleaner auch freien Platz auf der Festplatte überschreiben. Das ist zum Beispiel ratsam, wenn man Dateien mit vertraulichen Daten über den Windows-Papierkorb gelöscht hat. Diese lassen sich nämlich in der Regel wiederherstellen, was die Funktion "Drive Wiper" verhindert.