Nicht nur die Registry lässt sich mit WinOptimizer 12 defragmentieren, auch der Speicherplatz der Festplatte selbst kann mit dem Tool neu geordnet werden. Damit werden Dateien wieder hintereinander angeordnet, sodass die Festplatte diese wesentlich schneller wiederfindet und somit die Lese- und Schreibgeschwindigkeiten deutlich erhöht werden.