GitHub prÀsentiert offene Zusammenarbeit gegen COVID-19
(Bild: kentoh/Shutterstock.com)
Open-Source-Projekte gegen die Coronavirus-Pandemie stellen auf GitHub quelloffene Dashboards, DatensĂ€tze, Jupyter Notebooks und DIY-Anleitungen zur VerfĂŒgung.
GitHub prÀsentiert einige Gemeinschaftsprojekte zum Kampf gegen COVID-19. Die Plattform zur Versionsverwaltung hat Open-Source-Projekte zusammengestellt, die aus der internationalen Zusammenarbeit von Wissenschaftlern, Regierungsvertretern, Journalisten, Entwicklern und anderen engagierten Menschen hervorgegangen sind.
Ăbergeordnetes Ziel sei die gemeinsame BewĂ€ltigung der globalen Pandemie, und ein Blogpost stellt die laut GitHub derzeit relevantesten Projekte [1] vor. DarĂŒber hinaus bietet GitHub Projektverantwortlichen Hilfe unter anderem durch Zugang zu Produkten oder Diensten an und stellt fĂŒr das Folding@home-Projekt 60.000 Rechenstunden tĂ€glich zur VerfĂŒgung.
Proteinfalten mit verteilten RechenkapazitÀten
Die vorgestellten Projekte umfassen Dashboards fĂŒr Epidemiologen, Statistiker und Journalisten wie das Repository zum einschlĂ€gigen Dashboard der Johns Hopkins University [2], auf mehrere Rechner verteilte Datenverarbeitung fĂŒr das Folding@home zur UnterstĂŒtzung der RechenkapazitĂ€ten in der Impfmittelforschung [3] und eine noch in Entwicklung befindliche offizielle WHO-App [4].
Das Dashboard Nextstrain verfolgt die Entwicklung krankheitserregender Genome in Echtzeit [5] und analysiert die evolutionĂ€ren Beziehungen der Mutationen von COVID-19. Das Open-Source-Projekt stellt Impfmittel-Forschern weltweit schnell qualitativ hochwertige Daten bereit, die auf traditionellen Wegen zu lange brĂ€uchten. Die DatensĂ€tze stammen von der gemeinnĂŒtzigen Organisation GISAID (Global Initiative on Sharing All Influenza Data) [6], die eine Datenbank globaler Grippedaten betreibt.
Visualisierung mit Jupyter Notebooks und Anleitungen zur Selbsthilfe
Eine Gruppe von Freiwilligen aus dem Bereich Data Science hat zur Visualisierung Jupyter-Notebooks zusammengestellt [7], aus denen sich mit Fastpages einfache Blogs erzeugen [8] lassen. Den Quellcode der Vorhersagemodelle bettet Fastpages in die generierten Webseiten ein. Auch eine Anleitung zum Selbstbauen einfacher BeatmungsgerÀte [9] im Falle von EngpÀssen steht auf GitHub.
Manche Staaten wie Italien stellen Infektionsdaten in Echtzeit zur VerfĂŒgung [10], um KrankenhĂ€usern und Fabriken das Beschaffen von Versorgungsmitteln zu erleichtern. Die Kommune Wuhan betreibt ebenfalls ein Community-Projekt [11], um die Versorgung zu koordinieren. (sih [12])
URL dieses Artikels:
https://www.heise.de/-4688672
Links in diesem Artikel:
[1] https://github.blog/2020-03-23-open-collaboration-on-covid-19/
[2] https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19
[3] https://foldingathome.org/
[4] https://github.com/WorldHealthOrganization/app
[5] https://nextstrain.org/
[6] https://www.gisaid.org/
[7] https://covid19dashboards.com/
[8] https://fastpages.fast.ai/
[9] https://github.com/jcl5m1/ventilator
[10] https://github.com/pcm-dpc/COVID-19
[11] https://community.wuhan2020.org.cn/zh-cn/
[12] mailto:sih@ix.de
Copyright © 2020 Heise Medien