Die drei Einzelausgänge PL 201, 202 und 203 sind eigentlich ein Relikt aus Drei-Achs-Zeiten. Wer Sie nutzen will, muss entweder GRBL mit dem Step-Enable-Ausgang auf PC6 kompilieren (siehe cpu_pinout.h) oder die Verbindung zu PC6 auftrennen (das ist die Leiterbahn unter der "0" von R208) und das Ende an R208, R207, R206 mit PD5/ENA verbinden.
Insofern haben Sie recht: diese Inkompatibiltät hätte nicht sein müssen.
-cm