Nicht wirklich. Applets sind im Browser eingebettet. Wenn man eine typische Webanwendung schreiben will, braucht man sie nicht. Will man eigentlich eine Desktopanwendung bauen aber über das Web ausliefern, dann stört eigentlich, dass das Ding irgendwie im Browser laufen muss.
Und genau das ist die Idee von Webstart, deployment einer Anwendung übers Web. Das Problem ist, dass sich das eigentlich nur für ein Umfeld eignet, wo die JVM zuverlässig verfügbar ist und der Anwender nicht damit überfordert ist, diese zu installieren und aktuell zu halten.
Für das Deployment an den durchschnittlichen Endanwender ist das Einbetten einer JVM einfacher und zuverlässiger. Es bietet sich evtl. fürs Intranet an und evtl. für Linux, wenn man weiß, dass auf den typischen Distributionen eine ausreichend aktuelle JVM leicht installiert werden kann.