Ich nutze ubuntu ca. 1 Jahr. Habe problemlos von 14.10 auf 15.04, 15.10 und jetzt 16.04 nachinstalliert. Jeweils vorher Backups der Daten gemacht und gut war. Das läuft wie Updates, eine Vollinstallation war bisher nie nötig.
Natürlich wäre die LTS jetzt mal bequem, aber im Prinzip ist das genannte Problem lösbar.