Der Umgang mit vielen Postfächern ist in Apple Mail eher umständlich. Um Nachrichten schnell in Ordner einzusortieren, helfen zwar Favoriten, doch darüber hinaus muss man lange Listen oder verschachtelte Strukturen im Kontextmenü, der Seitenleiste oder der Symbolleiste durchforsten.

MsgFiler 4 läuft als eigenständiges Programm im Hintergrund – auf Wunsch auch ohne Dock-Symbol. In Apple Mail lässt es sich etwa über das anpassbare Tastenkürzel Command + 9 aufrufen. Das über Mail schwebende Fenster listet alle verfügbaren Ordner auf, die sich durch Eingabe eines Suchbegriffs filtern lassen. Mit den Pfeiltasten und Return schiebt man die ausgewählten Mails flugs und komplett ohne Maus in den gewünschten Ordner. Wahlweise lässt sich das Verhalten umschalten, sodass die Eingabetaste alternativ den Ordner öffnet, Mails kopiert oder nichts macht. Für jede Aktion gibt es eigene, frei definierbare Kürzel.